「營養系」隸屬醫療健康學院，營養醫學研究所(現今改名整併為營養系碩士班)創立於民國94年，為目前全國唯一成立的營養系碩士班。本所由於民國94年獲教育部獎助為期3年的94年度獎助發展學校重點特色專案計畫之「臨床醫學之營養研究暨醫學營養中心設置計畫」建立雛型，94學年度獲准籌備學研究所，由醫護學院(現今更名為醫療健康學院)陳伯中院長兼任籌備處主任，95學年度正式成立，96學年度配合全校學生數將本所碩士班學生數調整為9名，至今每學年度碩士班招生人數為9名，累計有16屆畢業生。