「營養系」隸屬醫療健康學院，營養醫學研究所(現今改名整併為營養系碩士班)創立於民國94年，為目前全國唯一成立的營養系碩士班。本所由於民國94年獲教育部獎助為期3年的94年度獎助發展學校重點特色專案計畫之「臨床醫學之營養研究暨醫學營養中心設置計畫」建立雛型，94學年度獲准籌備學研究所，由醫護學院(現今更名為醫療健康學院)陳伯中院長兼任籌備處主任，95學年度正式成立，96學年度配合全校學生數將本所碩士班學生數調整為9名，至今每學年度碩士班招生人數為9名，累計有16屆畢業生。

為配合社會與產業界人才之需求，校方於民國98年將民生學院食品暨應用生物科技系之食品科技組及營養科學組分別成立食品科技系及營養系(即本系)，其中營養系設置在醫護學院，委請營養醫學所陳伯中特聘教授負責籌設，於民國98年8月正式成立招生，以提供高中職校畢業生進修管道，以滿足中部職校營養、食品或餐飲相關科系畢業生在職進修之殷切需求。首屆日間部四技學生2班、進修部四技學生1班，截至111學年度，累計14屆畢業生。111學年度教育部核定，營養系暨營養醫學研究所更名整併為營養系、營養系碩士班。

本系承襲校、院教育理念，以培育營養專業領域人才為主軸，除致力營養師專業之臨床營養、團體膳食、社區營養與長期照顧及生醫營養之人才培育，使本系畢業生具有市場競爭力、專業的證照能力及為職場發展潛力。

本系目前擁有專任教師9位，教授3位、副教授2位、助理教授2位，專案助理教授2位。

系所發展經營與特色方面

營養系以培育具備營養專業及終身學習精神之人才為主軸，強調理論與實務並重的學習環境，除致力營養師專業之臨床營養、社區營養與長期照顧之人才養成外，亦依未來產業市場發展，培養具備營養領域相關儀器操作分析能力或推廣教育之專業人員。

營養系碩士班整合營養科學及保健醫學，研究設備與資源完整，培育學生利用細胞實驗、動物實驗、臨床試驗或流行病學調查等研究模式，探討天然化合物及營養素與疾病或健康者之間的相關性。以培育學生具備「營養科學知識整合、營養研究、實務應用」三大核心能力，提升營養科學應用及研究之實務能力。